防御是决定战斗胜负的关键因素之一。合理的防御策略不仅能减少受到的伤害，还能为反击创造机会。防御技巧的核心在于平衡攻防节奏，通过技能释放时机、走位躲避、秘卷搭配以及忍者选择等多方面因素综合提升生存能力。掌握这些技巧可以有效应对不同战斗场景，尤其在决斗场等高强度对战中尤为重要。
防御属性的提升主要通过装备强化、角色培养和秘卷技能实现。装备强化是基础手段，优先选择防御型装备如护腕或特殊服装，并通过强化和镶嵌宝石提升属性。角色培养方面，重点升级忍者的天赋和通灵系统，天赋系统提供的基础属性加成性价比较高，而通灵兽的培养能额外增加防御力。秘卷技能如禁术-阴愈伤灭或风遁-风沙阵可提供减伤或霸体效果，需根据对战场景灵活选择。组织玩法中的叛忍迎击和修行商店也能获取防御型资源。
面对高爆发忍者时，需预判对手奥义点消耗情况，保留替身术用于关键躲避。替身术的CD为15秒，需计算敌方替身时间以避免被反打。部分忍者技能如阿飞的设置炸弹大成功具有无敌帧效果，可规避伤害并反击。通灵兽的霸体效果适合在敌方替身后使用，既能保护自身也能打断对手连招。若敌方使用范围型秘卷如水龙卷，可通过垂直走位或反向位移脱离攻击范围。
忍者选择直接影响防御策略的可行性。优先选用具备防御特性的忍者，如我爱罗的砂盾或日向宁次的反击技能。面对空中压制型忍者（如迪达拉），需避免依赖地面技能，改用突进型或对空型忍者。阵容搭配上，建议前排放置高防御忍者吸收伤害，后排配置高输出或控制型角色。需熟悉敌方忍者的技能机制，例如宇智波鼬的天照可通过横向移动躲避，而蝎的铁矿砂攻击则需保持中距离周旋。
